EVA-ohjelma

NordGen on aktiivisesti osallistunut EVA-ohjelmiston kehittämiseen. Ohjelmiston avulla tehdään paritussuunnitelmia pienille kotieläinpopulaatioille ja hallitaan sukusiitosriskejä . Ohjelma on ladattavissa ilmaiseksi Windowsille, Linuxille ja Macille. Lue lisää ohjelmasta alla.

Useat paikalliset alkuperäisrodut ovat kooltaan hyvin pieniä, joten niiden uhkana ovat sekä sukusiitos että arvokkaan geneettisen monimuotoisuuden menetys, mikäli jalostusvalintaan ei kiinnitetä tarpeeksi huomiota. 

Nykyaikaiset jalostusohjelmat, joissa hyödynnetään kvantitatiivisia menetelmiä ja genomitietoa, ovat tehokkaita valittavien ominaisuuksien edistymisen osalta, mutta kääntöpuolena on sukusiitoksen lisääntyminen. Tästä syystä työkalut, joiden avulla voidaan kontrolloida sukusiitosta, ovat tarpeellisia pienten populaatioiden ylläpitämisessä.  

NordGen on osallistunut aktiivisesti EVA-ohjelmiston kehitystyöhön. Optimoimalla  sukusiitoksen ja geneettisen edistymisen välistä tasapainoa, EVA-ohjelmisto mahdollistaa pitkän aikavälin ​​ja kestävien jalostuspäätösten tekemisen populaation koosta tai rakenteesta riippumatta. EVAa on käytetty ja testattu menestyksekkäästi sekä kaupallisissa että uhanalaisissa populaatioissa Pohjoismaissa ja Baltiassa.

EVAlla voidaan määrittää seuraavia populaatiohistorian tunnuslukuja: 

  1.     Yksilölliset sukusiitoskertoimet ja sukupuuaineiston epätäydellisyys 
  2.     Keskimääräinen sukusiitosaste, sukulaisuuskerroin, sukupuun epätäydellisyys  ja sukupolvien vastaavuus sukupolvittain
  3.     Geneettisten osuuksien määrittäminen
  •       Kaikki perustajayksilöt
  •       suurivaikutteisimmat kantavanhemmat 
  •       Yksilöltä yksilölle tai ryhmälle

Optimaalisten geneettisten osuuksien määrittäminen 

  1.     EVA optimoi jalostusarvon ja keskimääräisen additiivisen suhteen lineaarisen funktion
  2.     Optimaalisten geneettisten osuuksien kannalta yksilöiden parituksessa voidaan käyttää väliaikaista paritusta tai jälkeläisen sukusiitoksen minimoivaa paritusta

EVAa varten tarvitaan järjestelmällinen sukupuuaineisto. Useimmiten tavallisen pöytätietokoneen kapasiteetti riittää EVAn käyttämiseen, ellei kyseessä ole erityisen suuri populaatio.

EVA on saatavilla ilmaiseksi Windowsille, Linuxille ja Macille, ja sen voi ladata alta:

Lataa Windowsille
Lataa Macille
Lataa Linuxille

Käsikirja

Suosittelemme, että luet alla olevan (englanninkielisen) käyttöoppaan päästäksesi paremmin alkuun. 

EVA käsikirja

Mikäli haluat viitata EVAan tieteellisissä artikkeleissa, kirjoitathan seuraavasti: 

Berg P., Nielsen J. and Sørensen M.K. 2006. EVA: Realized and predicted optimal genetic contributions. CD communication 27-09, 2pp. WCGALP, 2006, s.246.